Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrcdQ00LT2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms