Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms