Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba2P98084 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba2P98084 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba2P98084 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms