Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cry1P97784 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms