Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2cP97760 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2cP97760 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms