Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc1P97496 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms