Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas1P97459 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas1P97459 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas1P97459 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas1P97459 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas1P97459 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas1P97459 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas1P97459 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Npas1P97459 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms