Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhodP97348 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhodP97348 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhodP97348 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms