Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl21cP86793 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms