Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubg1P83887 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms