Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb2P81069 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms