Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx1P81068 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms