Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx3P81067 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx3P81067 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx3P81067 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx3P81067 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms