Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufd1P70362 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms