Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms