Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chl1P70232 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chl1P70232 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chl1P70232 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms