Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crabp1P62965 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms