Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms