Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms