Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vsnl1P62761 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsnl1P62761 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms