Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f4P62515 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms