Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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