Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abce1P61222 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abce1P61222 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Abce1P61222 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms