Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf13P61216 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf13P61216 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms