Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims4P60191 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims4P60191 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms