Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms