Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp4P59240 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms