Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrnp1P59054 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms