Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms