Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc1a3P56564 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms