Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf5P56477 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf5P56477 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf5P56477 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf5P56477 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms