Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms