Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms