Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fdft1P53798 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms