Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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