Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna1P52793 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efna1P52793 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms