Protein–RNA interactions for Protein: P52760

Rida, 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RidaP52760 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RidaP52760 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RidaP52760 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RidaP52760 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RidaP52760 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RidaP52760 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RidaP52760 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RidaP52760 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RidaP52760 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RidaP52760 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RidaP52760 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms