Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RorcP51450 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RorcP51450 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RorcP51450 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RorcP51450 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms