Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RoraP51448 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RoraP51448 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RoraP51448 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RoraP51448 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RoraP51448 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RoraP51448 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RoraP51448 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RoraP51448 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RoraP51448 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RoraP51448 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RoraP51448 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms