Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CastP51125 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CastP51125 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CastP51125 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CastP51125 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CastP51125 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CastP51125 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CastP51125 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CastP51125 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CastP51125 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CastP51125 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms