Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa8P50706 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa8P50706 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms