Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TspoP50637 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TspoP50637 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TspoP50637 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TspoP50637 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms