Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbrP50284 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms