Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcls1P49710 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms