Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc3P49135 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc3P49135 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc3P49135 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc3P49135 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc3P49135 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms