Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prox1P48437 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms