Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms