Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbx2P48031 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms