Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl5P47962 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms