Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl6P47911 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms